不同来源的蛋白,内参的选择
Commonly Used Organelle Markers
· Fractions · | Markers |
Cytosol (胞浆蛋白) | Actin(42 KD),GAPDH(37 KD), Tubulin(50 KD), HSP90(90 KD) |
Nuclear (胞核蛋白) | Lamin-B1(75 KD,Nuclear envelope) HDAC1(55 KD,Nucleolar) SC-35(35 KD,Nuclear speckle) NUP98(100 KD, Nuclear pore), Histones? P84(84KD,Nuclear Matrix) |
Plasma Membrane (细胞膜蛋白/器膜蛋白) | Na/K-ATPase(100KD) Pan-cadherin(135 KD, Tissue specific express.) |
Mitochondria (线粒体) | Cytochrome C Reductase Core protein (53 KD) ATP5A(55 KD,inner membrane) Tomm20(20 KD, outer membrane) VDAC(Mito outer membrane, and PM) |
Endoplasmic reticulum (ER)(内质网) | Calreticulin (55 KD,lumen) Calnexin (68 KD, ER membrane, PM) |
Golgi Complex (高尔基复合体) | GM130(130 KD,Cis golgi matrix) Syntaxin 6 or Lamb2 (29 KD, Golgi membrane) |
Lysosome (溶酶体) | LAMP2(100 KD, lysosome, PM, Endosome) M6PR 274,(lysosome membrane) LIMPIl/lpg85(54KD, Lysosome membrane) |
Proteasome (蛋白酶体) | PSMC1(49KD) |
Endosome (内含体) | EEA1(170KD)
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Exosome (外泌体) | CD63(26KD),Alix(96KD),CD9(25KD),CD81(26KD)
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Lipid Raft (脂筏) | Flotillin-1(47KD) |
内参的选择需要考虑实际的试验环境,比如某些细胞中,由于组织缺氧、糖尿病等因素会导致GAPDH的表达增高,不适合做内参。比如在在凋亡实验时,Lamin等也不适合作为内参。因此设计实验方案的时候应该考虑这些因素并查询相应文献,在实验过程中也应该注意如果内参表达出现异常,应考虑这方面因素。
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